from pheno_utils import PhenoLoader005-diet_logging
Diet logging dataset
Diet logging through a smartphone app encompasses the detailed recording of food and beverage intake. This includes specifics such as the varieties of food consumed, portion sizes, nutritional components, and the timing of meals. By tracking these dietary patterns, individuals can monitor their own eating habits, while researchers can use the aggregated data to gain valuable insights into broader dietary trends within a population. Furthermore, this information can be correlated with other time-based measurements and occurrences to yield a more comprehensive understanding of health and nutrition.
Data availability:
The information is stored in 3 parquet files: diet_logging.parquet, diet_logging_events.parquet, raw_diet_logging_events.parquetwhich contains summary information, processed diet logging data and raw diet logging data respectively.
pl = PhenoLoader('diet_logging')
plPhenoLoader for diet_logging with
10 fields
2 tables: ['diet_logging', 'age_sex']Data dictionary
pl.dict| field_string | description_string | folder_id | feature_set | field_type | strata | data_coding | array | pandas_dtype | bulk_file_extension | ... | stability | sexed | debut | completed | min_plausible_value | max_plausible_value | version | customer_field | dependency | parent_dataframe | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| tabular_field_name | |||||||||||||||||||||
| collection_date | Date | Datetime column relecting the time food item w... | 5.0 | diet_logging | Datetime | Collection time | NaN | Single | datetime64[ns] | NaN | ... | Accruing | Both sexes | 2019-01-29 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
| logging_day | Logging day per participant | Integer indicating which day of logging period | 5.0 | diet_logging_events | Integer | Primary | NaN | Single | int | NaN | ... | Accruing | Both sexes | 2019-01-29 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
| total_logging_days | Total number of days logged | Total number of days diet was logged per resea... | 5.0 | diet_logging | Integer | Primary | NaN | Single | int | NaN | ... | Accruing | Both sexes | 2019-01-29 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
| timezone | Timezone | Timezone | 5.0 | diet_logging | Text | Collection time | NaN | Single | string | NaN | ... | Accruing | Both sexes | 2019-01-29 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
| food_items | Food items | Total number of food items logged per day | 5.0 | diet_logging | Integer | Primary | NaN | Single | int | NaN | ... | Accruing | Both sexes | 2019-01-29 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
| diet_logging_events | Diet logging events | File path to diet logging events | 5.0 | diet_logging_events | Time series file (group) | Auxiliary | NaN | Single | string | parquet | ... | Accruing | Both sexes | 2019-01-29 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
| raw_diet_logging_events | Raw diet logging events | File path to raw diet logging events | 5.0 | raw_diet_logging_events | Time series file (group) | Auxiliary | NaN | Single | string | parquet | ... | Accruing | Both sexes | 2019-01-29 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
| usda_sf_legacy_mapping | USDA SF Legacy nutritional mapping | Nutritional mapping file to USDA SF-Legacy dat... | 5.0 | diet_logging_auxiliary | Mapping table (group) | Auxiliary | NaN | Single | category | csv | ... | Accruing | Both sexes | 2019-01-29 | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN | NaN |
| collection_timestamp | Collection timestamp | Collection timestamp | NaN | NaN | column | NaN | NaN | NaN | datetime64[ns, Asia/Jerusalem] | NaN | ... | Accruing | NaN | 2019-01-29 | NaN | NaN | NaN | NaN | ready | NaN | diet_logging_events |
| collection_date | Date | Datetime column relecting the time food item w... | NaN | NaN | column | NaN | NaN | NaN | datetime64[ns] | NaN | ... | Accruing | NaN | 2019-09-01 | NaN | NaN | NaN | NaN | ready | NaN | diet_logging_events |
| food_id | Food ID | IDs in the diet logging app representing speci... | NaN | NaN | column | NaN | NaN | NaN | int | NaN | ... | Accruing | NaN | 2019-09-01 | NaN | NaN | NaN | NaN | ready | NaN | diet_logging_events |
| weight_g | Weight | Weight of food item logged | NaN | NaN | column | NaN | NaN | NaN | float | NaN | ... | Accruing | NaN | 2019-09-01 | NaN | 0.0 | 2000.0 | NaN | ready | NaN | diet_logging_events |
| short_food_name | Short food name | Classifcation of food item logged into a short... | NaN | NaN | column | NaN | NaN | NaN | string | NaN | ... | Accruing | NaN | 2019-09-01 | NaN | NaN | NaN | NaN | ready | NaN | diet_logging_events |
| food_category | Food category | Classifcation of food item logged into a food ... | NaN | NaN | column | NaN | NaN | NaN | string | NaN | ... | Accruing | NaN | 2019-09-01 | NaN | NaN | NaN | NaN | ready | NaN | diet_logging_events |
| product_name | Product name | Product name of food logged | NaN | NaN | column | NaN | NaN | NaN | string | NaN | ... | Accruing | NaN | 2019-09-01 | NaN | NaN | NaN | NaN | ready | NaN | diet_logging_events |
| calories_kcal | Calories | Calories of food item logged | NaN | NaN | column | NaN | NaN | NaN | float | NaN | ... | Accruing | NaN | 2019-09-01 | NaN | 0.0 | 5000.0 | NaN | ready | NaN | diet_logging_events |
| carbohydrate_g | Carbohydrate intake per food logged | Carbohydrate intake per food logged | NaN | NaN | column | NaN | NaN | NaN | float | NaN | ... | Accruing | NaN | 2019-09-01 | NaN | NaN | NaN | NaN | ready | NaN | diet_logging_events |
| lipid_g | Fat intake per food logged | Fat intake per food logged | NaN | NaN | column | NaN | NaN | NaN | float | NaN | ... | Accruing | NaN | 2019-09-01 | NaN | NaN | NaN | NaN | ready | NaN | diet_logging_events |
| protein_g | Protein intake per food logged | Protein intake per food logged | NaN | NaN | column | NaN | NaN | NaN | float | NaN | ... | Accruing | NaN | 2019-09-01 | NaN | NaN | NaN | NaN | ready | NaN | diet_logging_events |
| sodium_mg | Sodium intake per food logged | Sodium intake per food logged | NaN | NaN | column | NaN | NaN | NaN | float | NaN | ... | Accruing | NaN | 2019-09-01 | NaN | NaN | NaN | NaN | ready | NaN | diet_logging_events |
| alcohol_g | Alcohol intake per food logged | Alcohol intake per food logged | NaN | NaN | column | NaN | NaN | NaN | float | NaN | ... | Accruing | NaN | 2019-09-01 | NaN | NaN | NaN | NaN | ready | NaN | diet_logging_events |
| dietary_fiber_g | Dietary fiber intake per food logged | Dietary fiber intake per food logged | NaN | NaN | column | NaN | NaN | NaN | float | NaN | ... | Accruing | NaN | 2019-09-01 | NaN | NaN | NaN | NaN | ready | NaN | diet_logging_events |
| local_timestamp | Local timestamp | Local timestamp of food logging | NaN | NaN | column | NaN | NaN | NaN | datetime64[ns] | NaN | ... | Accruing | NaN | 2019-09-01 | NaN | NaN | NaN | NaN | ready | NaN | diet_logging_events |
| eaten_in_restaurant | Eaten at restaurant indication | Indication if food was eatn at home or at a re... | NaN | NaN | column | NaN | NaN | NaN | bool | NaN | ... | Accruing | NaN | 2019-09-01 | NaN | NaN | NaN | NaN | ready | NaN | diet_logging_events |
| timezone | Timezone | Timezone | NaN | NaN | column | NaN | NaN | NaN | string | NaN | ... | Accruing | NaN | 2019-09-01 | NaN | NaN | NaN | NaN | ready | NaN | diet_logging_events |
| collection_timestamp | Collection timestamp | Collection timestamp | NaN | NaN | column | NaN | NaN | NaN | datetime64[ns, Asia/Jerusalem] | NaN | ... | Accruing | NaN | 2019-01-29 | NaN | NaN | NaN | NaN | ready | NaN | raw_diet_logging_events |
| collection_date | Date | Datetime column relecting the time food item w... | NaN | NaN | column | NaN | NaN | NaN | datetime64[ns] | NaN | ... | Accruing | NaN | 2019-09-01 | NaN | NaN | NaN | NaN | ready | NaN | raw_diet_logging_events |
| food_id | Food ID | IDs in the diet logging app representing speci... | NaN | NaN | column | NaN | NaN | NaN | int | NaN | ... | Accruing | NaN | 2019-09-01 | NaN | NaN | NaN | NaN | ready | NaN | raw_diet_logging_events |
| weight_g | Weight | Weight of food item logged | NaN | NaN | column | NaN | NaN | NaN | float | NaN | ... | Accruing | NaN | 2019-09-01 | NaN | 0.0 | 2000.0 | NaN | ready | NaN | raw_diet_logging_events |
| short_food_name | Short food name | Classifcation of food item logged into a short... | NaN | NaN | column | NaN | NaN | NaN | string | NaN | ... | Accruing | NaN | 2019-09-01 | NaN | NaN | NaN | NaN | ready | NaN | raw_diet_logging_events |
| food_category | Food category | Classifcation of food item logged into a food ... | NaN | NaN | column | NaN | NaN | NaN | string | NaN | ... | Accruing | NaN | 2019-09-01 | NaN | NaN | NaN | NaN | ready | NaN | raw_diet_logging_events |
| product_name | Product name | Product name of food logged | NaN | NaN | column | NaN | NaN | NaN | string | NaN | ... | Accruing | NaN | 2019-09-01 | NaN | NaN | NaN | NaN | ready | NaN | raw_diet_logging_events |
| calories_kcal | Calories | Calories of food item logged | NaN | NaN | column | NaN | NaN | NaN | float | NaN | ... | Accruing | NaN | 2019-09-01 | NaN | 0.0 | 5000.0 | NaN | ready | NaN | raw_diet_logging_events |
| carbohydrate_g | Carbohydrate intake per food logged | Carbohydrate intake per food logged | NaN | NaN | column | NaN | NaN | NaN | float | NaN | ... | Accruing | NaN | 2019-09-01 | NaN | NaN | NaN | NaN | ready | NaN | raw_diet_logging_events |
| lipid_g | Fat intake per food logged | Fat intake per food logged | NaN | NaN | column | NaN | NaN | NaN | float | NaN | ... | Accruing | NaN | 2019-09-01 | NaN | NaN | NaN | NaN | ready | NaN | raw_diet_logging_events |
| protein_g | Protein intake per food logged | Protein intake per food logged | NaN | NaN | column | NaN | NaN | NaN | float | NaN | ... | Accruing | NaN | 2019-09-01 | NaN | NaN | NaN | NaN | ready | NaN | raw_diet_logging_events |
| sodium_mg | Sodium intake per food logged | Sodium intake per food logged | NaN | NaN | column | NaN | NaN | NaN | float | NaN | ... | Accruing | NaN | 2019-09-01 | NaN | NaN | NaN | NaN | ready | NaN | raw_diet_logging_events |
| alcohol_g | Alcohol intake per food logged | Alcohol intake per food logged | NaN | NaN | column | NaN | NaN | NaN | float | NaN | ... | Accruing | NaN | 2019-09-01 | NaN | NaN | NaN | NaN | ready | NaN | raw_diet_logging_events |
| dietary_fiber_g | Dietary fiber intake per food logged | Dietary fiber intake per food logged | NaN | NaN | column | NaN | NaN | NaN | float | NaN | ... | Accruing | NaN | 2019-09-01 | NaN | NaN | NaN | NaN | ready | NaN | raw_diet_logging_events |
| local_timestamp | Local timestamp | Local timestamp of food logging | NaN | NaN | column | NaN | NaN | NaN | datetime64[ns] | NaN | ... | Accruing | NaN | 2019-09-01 | NaN | NaN | NaN | NaN | ready | NaN | raw_diet_logging_events |
| eaten_in_restaurant | Eaten at restaurant indication | Indication if food was eatn at home or at a re... | NaN | NaN | column | NaN | NaN | NaN | bool | NaN | ... | Accruing | NaN | 2019-09-01 | NaN | NaN | NaN | NaN | ready | NaN | raw_diet_logging_events |
| timezone | Timezone | Timezone | NaN | NaN | column | NaN | NaN | NaN | string | NaN | ... | Accruing | NaN | 2019-09-01 | NaN | NaN | NaN | NaN | ready | NaN | raw_diet_logging_events |
42 rows × 26 columns